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在苯胺被甲醛縮合的過程中由于氨基對電子的推動作用使得氨基對位氫原子更加活潑,因而產物會以44位的二氨基即對位產物為主要產物,由此純的MDI結構也應該是44位的對位,而不會把純的24位鄰位MDI稱為純MDI。由于MDI分子本身的高度對稱使得其在常規條件下更容易結晶,故而常溫下是一種晶體的形態,在使用前往往需要先融化,存儲時也要保持低溫以免發生自聚行為影響使用。另外由于兩NCO基團(紅色)間隔較遠即彼此相對獨立,在參與反應性時,不像TDI分子中的NCO那樣容易受到位阻及誘導的影響,所以活性相對較高。